在1992年，十多位來自不同背景的香港居民因各種因緣，前往花蓮參訪靜思精舍。在那次的花蓮之行，他們親炙上人，請益佛法，短短數天的參訪中，這十數人的體會各不同，但都成為他們日後成立香港聯絡處的動力。

1992年5月，經港返臺的美國志工黃思賢，認為港臺這樣近，又是中國大陸的門戶，實應設立慈濟據點，表示他會請上人批准在香港設一聯絡處，同時邀請唐慧齡女士擔負此重任。旋即，上人批准成立香港聯絡處。

1993年8月，志工唐麗蓉發心捐獻灣仔道的房子作為聯絡處的會所，8月16日慈濟香港聯絡處正式成立。

1997年在本會的大力支援下，香港慈濟人在8月搬進九龍塘沙福道、佔地九千多平方呎的新會址，香港聯絡處也在此時升格為分會。

慈濟香港分會自成立以來，謹遵上人「自力更生，就地取材」的信念，因應本地的文化與民情，緊跟本會的腳步，就四大志業、八大法印，作重點的實施；除了積極推動慈善、醫療、教育、人文志業外，在中國賑災及環境保護也投入不少心血；其中環保推動的成效，獲得政府極大的肯定，與政府合作營運社區回收網絡。而近年世界各地天災頻繁，志工走上街頭做國際賑災募心募款的次數也漸多。

1994年10月起每週一次探訪醫院關懷家庭支持薄弱的病患、盲人院、護老院、精神康復者、弱能兒童學校外，也從事個案關懷、街友探訪、急難救助、義檢等慈善工作。同時也致力推動人文教育，開展品德教育，提升人文涵養，靜思語教學等；舉辦兒童親子成長班。2009年起為家境困難的學生，執行「安心就學」計劃。

2003年3月爆發「非典」後，慈濟志工迅速行動起來，前往醫院、社區派發口罩，也致送親手製作的慰問卡，為英勇的前線醫護人員加油打氣。

4月中旬，在獲知大批醫護人員受感染的消息後，分會透過隸屬於醫管局的心靈綠洲，送了一批心靈資糧，包括光碟機，讓患病的醫護人員可以收聽心理醫生的錄音、慈濟歌曲等光碟，慰藉他們的心靈。

2008年開始香港人醫成員深入關懷全港最貧窮地區之一的天水圍居民，舉行義檢活動，首批是為294位天水圍鄉親進行身體健檢，守護健康。

2020年起受疫情影響以來，在全港不同的社區、院舍、機構、學校派發口罩、酒精搓手液、病原快速測試劑等防疫物資；同時也推出失業補助計劃，以紓解失業人士的燃眉之急，也捐贈空氣清新機到護老院，減低長者受到感染的風險。

為減輕基層家庭的經濟壓力，關懷獨居長者、街友等，進行「大愛共伴 造福行善」社區關懷計劃，派發裝有食糧及抗疫物資的祝福包，希望讓他們感受到人間有愛，幫助他們度過難關。

嚴峻的新冠病毒疫情下，前線醫護為守護民衆健康疲於奔命，其中不少人還受到感染。透過醫管局的安排，捐贈由花蓮慈濟醫院研發、經臨床數據顯示，具有預防、治療功能的「淨斯本草飲」，希望加強他們身體的防護能力，並為他們打氣加油。

近年全球氣候異常，導致災害頻傳，環保工作刻不容緩；2009年香港第一個環保教育站「大圍環保教育站」成立，香港環保志業自此推動發展。致力在全港社區推動「清淨在源頭、精質分類」的環保理念，並設立街站及環保教育站進行宣導、回收，成效非凡，得到政府及市民大眾的肯定與熱烈迴響。

2020年12月底開始，慈濟參與環保署「綠在區區」計劃中的「綠在鰂魚涌」回收便利點，讓市民在日常生活中，養成回收的良好習慣。

而為了讓民眾更深刻了解環保的重要性及能身體力行，響應證嚴法師推動「清淨在源頭，簡約好生活」的倡議精神。每個人只要有心，把地球看成自己的生命般愛護，用雙手做好垃圾分類回收，一定有機會改變環境。環保要「共知、共識、共行」的理念。2021年12月在大圍成立「環保願行館」，為慈濟環保志業樹立了一個新的里程碑。